Ia kemudian bergabung ke Almeria pada 2023 dan mencatatkan 63 penampilan dengan torehan dua gol dan delapan assist.
Dengan kedatangan Pubill, Atletico kini memiliki bek kanan utama U-21 Spanyol serta bek kiri timnas U-21 Italia, Matteo Ruggeri. Selain itu, skuad besutan Diego Simeone tersebut juga diperkuat tiga pemain peraih medali emas Olimpiade, yakni Álex Baena, Pablo Barrios, dan Marc Pubill.